Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg16l1Q8C0J2 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms