Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Snx16Q8C080 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snx16Q8C080 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
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