Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 4930456G14Rik-201ENSMUST00000193054 1330 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm12227-201ENSMUST00000147847 563 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm20641-201ENSMUST00000176069 615 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm29611-201ENSMUST00000186132 1011 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Gm42964-201ENSMUST00000202965 382 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Csn1s2b-201ENSMUST00000072539 810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Milr1-202ENSMUST00000106794 1514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Trim35Q8C006 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm13183-201ENSMUST00000118615 789 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm22588-201ENSMUST00000157510 140 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm17075-201ENSMUST00000171924 670 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm27225-201ENSMUST00000183833 557 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 AC154730.1-201ENSMUST00000227874 816 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm42975-201ENSMUST00000200612 1491 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm14854-201ENSMUST00000117758 841 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm9499-201ENSMUST00000180888 964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm42464-201ENSMUST00000196717 417 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Vmn1r85-202ENSMUST00000209822 1251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 RMST_1.1-211ENSMUST00000219726 783 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Trim35Q8C006 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms