Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tmem260Q8BMD6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms