Protein–RNA interactions for Protein: Q8BM39

Prpf18, Pre-mRNA-splicing factor 18, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf18Q8BM39 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prpf18Q8BM39 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Prpf18Q8BM39 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prpf18Q8BM39 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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