Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKN5

Tubgcp5, Gamma-tubulin complex component 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp5Q8BKN5 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tubgcp5Q8BKN5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tubgcp5Q8BKN5 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms