Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Usp1Q8BJQ2 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms