Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cdca8Q8BHX3 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cdca8Q8BHX3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms