Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFS6

Cpped1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpped1Q8BFS6 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cpped1Q8BFS6 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cpped1Q8BFS6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms