Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc50Q810U5 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc50Q810U5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms