Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ChfrQ810L3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ChfrQ810L3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms