Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZD8

Amigo1, Amphoterin-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amigo1Q80ZD8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Amigo1Q80ZD8 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Amigo1Q80ZD8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Amigo1Q80ZD8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Amigo1Q80ZD8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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