Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z25

Ofd1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ofd1Q80Z25 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ofd1Q80Z25 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ofd1Q80Z25 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms