Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ttc28Q80XJ3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ttc28Q80XJ3 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
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