Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Zbed4Q80WQ9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Zbed4Q80WQ9 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
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Zbed4Q80WQ9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zbed4Q80WQ9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms