Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrc1Q80VQ1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lrrc1Q80VQ1 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms