Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Fancd2Q80V62 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Fancd2Q80V62 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms