Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Avl9Q80U56 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Avl9Q80U56 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Avl9Q80U56 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Avl9Q80U56 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Avl9Q80U56 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Avl9Q80U56 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Avl9Q80U56 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Avl9Q80U56 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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