Protein–RNA interactions for Protein: Q80U35

Arhgef17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 2,057 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef17Q80U35 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
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Arhgef17Q80U35 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Arhgef17Q80U35 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Arhgef17Q80U35 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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