Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pja2Q80U04 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pja2Q80U04 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms