Protein–RNA interactions for Protein: Q80SY5

Prpf38b, Pre-mRNA-splicing factor 38B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38bQ80SY5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prpf38bQ80SY5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prpf38bQ80SY5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms