Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Lamp3Q7TST5 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Lamp3Q7TST5 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms