Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSK3

Pcdh8, Protocadherin-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh8Q7TSK3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Pcdh8Q7TSK3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pcdh8Q7TSK3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms