Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PhkbQ7TSH2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PhkbQ7TSH2 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms