Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Dsg1bQ7TSF1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Dsg1bQ7TSF1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Dsg1bQ7TSF1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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