Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Dsg1cQ7TSF0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.9 ms