Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Prrc2bQ7TPM1 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Prrc2bQ7TPM1 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms