Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Higd1cQ76I25 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms