Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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Rpl35Q6ZWV7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl35Q6ZWV7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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