Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tfap2eQ6VUP9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tfap2eQ6VUP9 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms