Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rhox8Q6VSS7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rhox8Q6VSS7 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms