Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b3Q6UQ17 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b3Q6UQ17 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b3Q6UQ17 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b3Q6UQ17 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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Atp8b3Q6UQ17 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp8b3Q6UQ17 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp8b3Q6UQ17 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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