Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Bnip1Q6QD59 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Bnip1Q6QD59 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms