Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn2Q6PHP6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
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Lrrn2Q6PHP6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Lrrn2Q6PHP6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms