Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Tmeff1Q6PFE7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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