Protein–RNA interactions for Protein: Q6PE13

Prrt3, Proline-rich transmembrane protein 3, mousemouse

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Length 971 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt3Q6PE13 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Hesx1-201ENSMUST00000035433 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm19331-201ENSMUST00000193799 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Prrt3Q6PE13 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Prrt3Q6PE13 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
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