Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDY0

Ccdc85b, Coiled-coil domain-containing protein 85B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccdc85bQ6PDY0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccdc85bQ6PDY0 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms