Protein–RNA interactions for Protein: Q6PAR5

Gapvd1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gapvd1Q6PAR5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Gapvd1Q6PAR5 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gapvd1Q6PAR5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.7 ms