Protein–RNA interactions for Protein: Q6PA06

Atl2, Atlastin-2, mousemouse

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl2Q6PA06 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Atl2Q6PA06 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Atl2Q6PA06 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms