Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rrp12Q6P5B0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rrp12Q6P5B0 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms