Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Stmnd1Q6P3A1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Stmnd1Q6P3A1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms