Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gpbp1l1Q6NZP2 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1l1Q6NZP2 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms