Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXK8

Asic1, Acid-sensing ion channel 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asic1Q6NXK8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Asic1Q6NXK8 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms