Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Amer3Q6NS69 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Amer3Q6NS69 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms