Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU8

Atg16l2, Autophagy-related protein 16-2, mousemouse

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l2Q6KAU8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atg16l2Q6KAU8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atg16l2Q6KAU8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms