Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX2

Krt42, Keratin, type I cytoskeletal 42, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt42Q6IFX2 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Krt42Q6IFX2 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms