Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arhgap20Q6IFT4 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Arhgap20Q6IFT4 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms