Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Carmil1Q6EDY6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Carmil1Q6EDY6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms