Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Scaf8Q6DID3 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms