Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q6DFW0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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